Během pravěku byla oblasť současného Kitssee a rakouského okolí neustále osídlena. Byly to různé první kultury, našly se kousky keramiky, kousek lidské lebky z doby bronzové. Celé období po novověk bylo různé bouřlivé. Při vpádu Turků do této oblasti se neubránilo ani Kittsee. Z původních staveb v celé obci zanikly téměř všechny, avšak zůstala věž původního pohanského chrámu, z něj nesbourali pevnou kamennou věž, která dnes stojí v dálce za obcí ve směru k Vídni, viditelná je z dálnice nebo ze silnice na Bruck an der Leita.
        Od roku 1670 byla oblast pod správou knížete Esterházyho. Mohli se zde usadit i Židé. Žilo jich tu několik stovek, ale přirozený odliv lidí z oblasti způsobil i snížení počtu Židů. Mezi tím v podstatě celou písemně zachovalou historii si dělali nároky Maďaři na území, které jim v žádném případě nepatřilo, protože na toto území přišli dávno po předcích Rakušanů a po předcích Slováků.
 

Právě Maďaři usilovali o území regionu Burnegland tak vehementně, že Kittsee opravdu svého času patřilo pod Uhry. Po skončení první světové války a po zdlouhavém vyjednávání získalo Rakousko díky Trianonské dohodě území a začlenilo ho v podstatě až nyní vzniklého názvu regionu Burgenland. Během druhé světové války nastal prudký pokles židovského obyvatelstva i emigrací. V regionu mnozí vězni zemřeli při stavbě ochranného zdi proti postupu sovětských vojsk.

Do roku 1990 byla obec Kittsee klidná a tichá. Ležela těsně za železnou oponou, uzavřenými hranicemi se Slovenskou. Zatímco místní viděli na Slovensko a Slováci viděli do Kittsee, mnozí nevěřili, že se jednou na toto místo podívají a stalo se tak otevření hranic. Kittsee se postupně stávalo i místem na nákupy. Mnozí Bratislavané a Slováci z okolí sem měřili cestu na nákupy a rakouský schilling byl stále více známým platidlem i u nás.